Microbioma Cancer Detect
Identificação de biomarcadores baseados em microbioma em biópsia líquida para screening e diagnóstico precoce de câncer colorretal
Sobre o Projeto
CNPq/MS-SCTIE-DECIT Nº 50/2022 - vigência 01/06/2023 à 30/11/2025
Financiamento
Introdução
O Câncer Colorretal (CCR) é o segundo tumor mais frequente em ambos os sexos no Brasil e um dos mais letais, com previsão de aumento de casos nas próximas décadas. Portanto, observamos que:
• O rastreamento precoce do CCR reduz a incidência e mortalidade;
• O Ministério da Saúde recomenda rastreamento entre 50-75 anos, mas não possui política nacional organizada para esta finalidade, apenas iniciativas regionais;
• Estudos demonstram que a microbiota intestinal influencia o desenvolvimento e progressão do CCR;
• Pesquisas translacionais identificaram o papel patogênico da Fusobacterium nucleatum, na carcinogênese colorretal.
Recentemente, o nosso grupo, mostrou a eficácia de um programa de rastreamento colorretal implementado na região de Barretos.
Objetivos Gerais
• Desenvolver um teste ultrassensível de ddPCR (droplet digital PCR) para auxílio no diagnóstico precoce do câncer colorretal em biópsia líquida (fezes), baseado no microbioma intestinal.
Objetivos Específicos
• Identificar o perfil taxonômico e funcional da comunidade microbiana por Next Generation Sequencing (minION) nas amostras de fezes obtidas;
• Correlacionar as alterações dos perfis de bactérias nas fezes obtidas a partir de FIT com os achados da colonoscopia;
• Criar teste genético multiplex para ddPCR para detectar bactérias identificadas e validar sua precisão na detecção de adenomas precoces, avançados e câncer colorretal em amostras FIT positivas;
• Validar o teste multiplex em uma população prospectiva de rastreamento do CCR do Hospital de Amor nas amostras de FIT;
• Integrar o teste multiplex juntamente com metodologias padrão-ouro de rastreamento do câncer colorretal para desenvolver novos algoritmos de decisão;
• Promover estudos de ATS para subsidiar a tomada de decisão no SUS, no que concerne a incorporação, alocação e utilização de tecnologias em saúde.
Metodologia
O projeto será desenvolvido em várias etapas como pode ser observado no fluxograma abaixo:
Em cada etapa serão realizados os seguintes procedimentos:
• O DNA microbioma será extraído das amostras FIT positivas de 100 participantes sem lesões e 100 com lesões precursoras ou câncer, submetidos à colonoscopia no programa de rastreamento;
• O perfil microbiano será identificado por Next Generation Sequencing (MinION), buscando além da F. nucleatum, outras bactérias relacionadas ao CCR;
• Um teste multiplex de PCR ultrassensível será desenvolvido para detectar essas bactérias tumorigênicas como biomarcadores;
• Posteriormente, será validado em amostras de FIT de 500 participantes do programa de rastreamento, auxiliando no diagnóstico de lesões precursoras e CCR na população brasileira.
Resultados Esperados
Neste presente estudo, pretende-se, inicialmente identificar o perfil taxonômico e funcional da comunidade microbiana nas amostras de fezes contidas nos tubos de FIT dos participantes do rastreamento colorretal que apresentem diferentes achados na colonoscopia diagnostica após FIT positivo. Após identificação das bactérias associadas a tumorigênese, desenvolver um teste ultrassensível pelo ddPCR, e avaliar a sensibilidade e especificidade no diagnóstico lesões percursoras (adenoma precoce e avançado) e do câncer colorretal.
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26 de junho 2024