CPOM - Bioinformática

O Centro de Pesquisa em Oncologia Molecular do Hospital de Amor é parte integrante de diversos consórcios internacionais genômicos de grande visibilidade na oncologia tais como o The Cancer Genome Atlas (TCGA) e o International Cancer Genome Consortium (ICGC), além de outras diversas parcerias nacionais e internacionais de renome. Dentro desse cenário, a plataforma de apoio de Bioinformática desempenha um papel fundamental na análise de dados de larga escala dentro dos projetos de pesquisa do CPOM e é considerada como um “setor transversal”, atuando também no desenvolvimento de ferramentas e soluções do setor de diagnóstico molecular e oncologia translacional.

Análises de dados genômicos

Para apoiar a pesquisa oncológica translacional, a equipe bioinformatas busca os seguintes objetivos:
• Análises de bioinformática: Análises em larga escala de sequenciamento de nova geração e de expressão gênica para projetos do IEP e do diagnóstico molecular.
• Tipos de dados: Sequenciamento de nova geração (whole genome sequencing e whole exome sequencing), análise de dados de diferentes tipos tumorais, predição de classes e enriquecimento funcional.
• Plataformas: Illumina, Ion torrent, Nanostring, Agilent microarrays, PCR-arrays, Phospho-arrays.
• Treinamento: Cursos de pós-graduação em NGS, R e bancos de dados genômicos.

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Responsável: Dra. Luciane Sussuchi da Silva
E-mail: luciane.sussuchi@hospitaldeamor.com.br
Telefone de contato: (17) 3321-6600 ramal 7350

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