CPOM - Bioinformática

O Centro de Pesquisa em Oncologia Molecular do Hospital de Amor atualmente é parte integrante de diversos consórcios internacionais genômicos de grande visibilidade na oncologia, tais como o The Cancer Genome Atlas (TCGA) e o International Cancer Genome Consortium (ICGC), além de diversas parcerias internacionais de renome. Dentro desse cenário, a plataforma de apoio da Bioinformática desempenha um papel na análise de dados em larga escala contando hoje com mais de 100Tb (terabytes) de dados distribuídos em 2 servidores (um de backup e um de processamento). Além de storage e processamento de dados em nuvem (plataforma GoogleCloud). Já foram processadas centenas de análise de dados de sequenciamento genoma completo (whole-genome) e de mais de mil exomas (whole-exome), posicionando hoje o Hospital de Amor na instituição com maior número de dados de sequenciamento genômico de câncer do Brasil. Além disso, o setor da Bioinformática também atua como um ponto de suporte, considerado com “setor transversal”, na maioria os projetos de pesquisa do CPOM e até mesmo no desenvolvimento de ferramentas e soluções de demandas do setor de diagnóstico molecular da instituição.

Análises de dados genômicos e de expressão gênica

É designado a análises de dados genômicos e de expressão gênica. Para apoiar a pesquisa oncológica translacional a equipe bioinformatas busca os seguintes objetivos:
• Análises de bioinformática: Análises em larga escala de sequenciamento de nova geração e de expressão gênica para projetos do IEP e do diagnóstico molecular.
• Tipos de dados: Sequenciamento de nova geração (whole genome sequencing e whole exome sequencing), análise de dados de diferentes tipos tumorais, predição de classes e enriquecimento funcional.
• Plataformas: Illumina, Ion torrent, Nanostring, Agilent microarrays, PCR-arrays, Phospho-arrays.
• Treinamento: Cursos de pós-graduação em NGS, R e bancos de dados genômicos.
• Busca de oportunidades/perspectivas: Melhoria na estrutura para processamento de dados em larga-escala.

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Responsável: Adriane Feijó Evangelista
E-mail: adriane.feijo@gmail.com
Telefone de contato: (17) 3321-6600 ramal 7350

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Sala Bioinformática

Calendário de Eventos

02 e 03 de Setembro | 2022

CPOM

VIII International Symposium on Translational Oncology

Seguindo com sua missão de formar pesquisadores e disseminar dentre estes e dentre oncologistas, residentes, alunos de pós-graduação e demais profissionais de saúde os principais temas oncológicos da atualidade, o Instituto de Ensino e Pesquisa do Hospital do Câncer de Barretos (IEP) realizará o VIII Simpósio Internacional de Oncologia Translacional do Hospital de Câncer de Barretos.