Na frente de Ensino, o Instituto de Ensino e Pesquisa conta com o Programa de Pós-graduação em Oncologia nas modalidades: Lato Sensu (Especialização) e Stricto Sensu (Mestrado, Doutorado e Doutorado), que recentemente passou a oferecer também a modalidade de Mestrado Profissional, em parceria com a Faculdade de Ciências da Saúde de Barretos - Dr. Paulo Prata (FACISB). Até o momento, mais de 154 bancas de defesas já foram realizadas dentro do Programa.

A modalidade Stricto Sensu iniciou suas atividades em abril de 2011, no nível de Mestrado (acadêmico), após recomendação da CAPES (Coordenação de Aperfeiçoamento do Pessoal de Nível Superior), com conceito 4. A aprovação do programa de doutorado ocorreu um ano mais tarde, com início das atividades em março de 2012.

Atualmente o Programa de Pós-graduação em seu caráter acadêmico (Mestrado, Doutorado e Doutorado Direto) possui o conceito 6 segundo a CAPES, e oferece as seguintes linhas de pesquisa: Cuidados Paliativos e Qualidade de Vida, Epidemiologia e Prevenção em Câncer, Oncologia Clínica e Cirúrgica e Oncologia e Patologia Molecular.